可廣泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究產(chǎn)品介紹羥甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，hMeDIP-Seq)，
是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段，結(jié)合NGS測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域;
可廣泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究。
重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控，用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目
專注表觀組學(xué)10年，提供專業(yè)有價(jià)值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開發(fā)羥甲基化測(cè)序技術(shù)的團(tuán)隊(duì)，提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);
助力客戶在Clin Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文;
專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設(shè)計(jì)
從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析;
每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、動(dòng)物組織等
按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸
數(shù)據(jù)分析
hMeDIP-seq
分析內(nèi)容
備注
標(biāo)準(zhǔn)分析
1、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、與參考基因組比對(duì)
測(cè)序Reads 在基因組上的分布
3、5hmC Peak峰Calling
5hmC富集區(qū)域鑒定
4、5hmCPeak圖譜分析
5hmCPeak在基因組，染色體，功能元件上的分布
6、組間差異5hmCPeak分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmCPeak基因分析
相關(guān)基因GO，KEGG富集分析
高級(jí)分析
8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
9、其它定制化分析
結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘
產(chǎn)品介紹羥甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，hMeDIP-Seq)，
是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段，結(jié)合NGS測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域;
可廣泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究。
重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控，用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目
專注表觀組學(xué)10年，提供專業(yè)有價(jià)值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開發(fā)羥甲基化測(cè)序技術(shù)的團(tuán)隊(duì)，提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);
助力客戶在Clin Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文;
專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設(shè)計(jì)
從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析;
每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、動(dòng)物組織等
按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸
數(shù)據(jù)分析
hMeDIP-seq
分析內(nèi)容
備注
標(biāo)準(zhǔn)分析
1、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、與參考基因組比對(duì)
測(cè)序Reads 在基因組上的分布
3、5hmC Peak峰Calling
5hmC富集區(qū)域鑒定
4、5hmCPeak圖譜分析
5hmCPeak在基因組，染色體，功能元件上的分布
6、組間差異5hmCPeak分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmCPeak基因分析
相關(guān)基因GO，KEGG富集分析
高級(jí)分析
8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
9、其它定制化分析
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