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張老師

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深圳市光明區(qū)鳳凰街道鳳凰社區(qū)招商局光明科技園A4棟13樓

簡化基因組甲基化測序 (RRBS)

簡化基因組甲基化測序 (RRBS)通過酶切富集啟動子及CpG 島區(qū)域，并進(jìn)行Bisulfite 測序

0755-28507994

產(chǎn)品介紹

簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing，RRBS)，

通過酶切富集啟動子及CpG 島區(qū)域，并進(jìn)行Bisulfite 測序;

作為高性價(jià)比的甲基化研究方法，RRBS在大規(guī)模臨床樣本的研究中具有普遍的應(yīng)用;

在經(jīng)典RRBS基礎(chǔ)上，艾斯基因在國內(nèi)較早推出強(qiáng)化版 RRBS，助力全基因組甲基化測序，

可覆蓋全基因組范圍內(nèi)超過6-9M個CpG 位點(diǎn)，>90%數(shù)量的CpG島及>85%數(shù)量的基因啟動子。

重點(diǎn)技術(shù)質(zhì)控，用心服務(wù)每一個項(xiàng)目

艾斯團(tuán)隊(duì)專注表觀組學(xué)10年，提供專業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

較早開發(fā)RRBS技術(shù)團(tuán)隊(duì)之一, 國內(nèi)較早推出強(qiáng)化版RRBS服務(wù);

已經(jīng)完成人、哺乳動物及魚類等多個物種, 10000+例樣本項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);

嚴(yán)格的RRBS技術(shù)質(zhì)控，MSPI酶切率>95%, Bisulfite轉(zhuǎn)化率>99%;

自動化樣本處理、建庫及分析流程，保障高效周期，40天極速交付;

低至10ng建庫，滿足穿刺、流式分選、微切等微量珍貴樣本的研究;

重點(diǎn)團(tuán)隊(duì)在Nature、Epigenetics、DNA Res等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個性化分析思路和方案。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析;

每個項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型	樣本要求
基因組DNA	總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、動物新鮮冷凍組織	按照送樣要求準(zhǔn)備
備注1：不推薦FFPE、cfDNA等片段化樣本類型；備注2：不適合植物物種；
備注2：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

數(shù)據(jù)分析

RRBS	分析內(nèi)容	備注
標(biāo)準(zhǔn)分析	1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估	過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
	2、與參考基因組比對	比對率和覆蓋度分析
	3、MSPI酶切及Bisulfite轉(zhuǎn)化率質(zhì)控	MSPI酶切效率>95%; Bisulfite轉(zhuǎn)化率>99%
	4、甲基化位點(diǎn)Calling	評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)
	5、甲基化分布圖譜分析	甲基化在基因組、功能元件上的分布
	6、組間差異甲基化DMR分析	尋找DMR及注釋
	7、差異甲基化基因DMG分析	DMG富集分析GO，KEGG
	8、多樣本聚類分析	PCA分析多樣本甲基化變化規(guī)律
高級分析	9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析	例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
高級分析	10、其它定制化分析	結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘