提供cfDNA甲基化多方位技術(shù)解決方案

　　cfDNA (circulating-free cell DNA), 又稱循環(huán) DNA 或無細(xì)胞DNA, 是指存在于血漿或血清的細(xì)胞外DNA;

　　ctDNA(circulating tumor DNA)攜帶了腫瘤基因組一定的突變信息(SV、indel、CNV等)，

　　還攜帶表觀修飾信息5mC甲基化和5hmC羥甲基化及結(jié)構(gòu)信息(片段長度、斷裂特征等);

　　其中DNA甲基化5mC修飾具有獨特的應(yīng)用價值，普遍用于腫瘤疾病早篩早診、復(fù)發(fā)預(yù)后等應(yīng)用

　　基于cfDNA甲基化biomarker篩選技術(shù)路線

　　潛在甲基化biomarker篩選步驟，結(jié)合樣本及成本的實際情況，按照以下3種方式進行：

　　1、以現(xiàn)有的TCGA甲基化芯片數(shù)據(jù)庫進行篩選潛在的biomarker及建模;

　　2、從腫瘤組織樣本入手，篩選腫瘤特異性的biomarker，推薦更高性價比的RRBS方案;

　　3、直接以血漿/血清cfDNA樣本進行WGBS測序篩選biomarker及建模。

　　在驗證步驟，對潛在的biomarker及模型的驗證，

　　通常采用靶向甲基化Panel對大樣本血漿/血清cfDNA的臨床驗證。

　　完整解決方案，服務(wù)每一個項目

　　艾斯基因?qū)Ｗ⒈碛^組學(xué)10年，提供專業(yè)的DNA甲基化完整解決方案;

　　已經(jīng)完成3000+例樣本cfDNA甲基化項目經(jīng)驗;

　　解決從血液采集保存、cfDNA分離提取(>90%得率)，

　　低至15ng輸入量的微量全基因組甲基化文庫構(gòu)建，

　　及cfDNA靶向甲基化Panel定制測序一整套技術(shù)方案;

　　多方位助力cfDNA甲基化biomarker篩選及轉(zhuǎn)化應(yīng)用。

　　技術(shù)方案及樣本要求

　　cfDNA樣本準(zhǔn)備注意事項

　　在體內(nèi)cfDNA在血漿里核酸酶的作用下，不斷降解消失，

　　同時新的ctDNA和cfDNA進入血漿中，維持一定的動態(tài)和半衰期;

　　抽血離體之后ctDNA會繼續(xù)降解、含量逐步減少，

　　而來自白血細(xì)胞的cfDNA持續(xù)進去血漿，進而稀釋ctDNA濃度，降低檢測信號。

　　因此，在采血、血漿分離及保存運輸，每一步操作都會影響數(shù)據(jù)的質(zhì)量

　　為了結(jié)果的穩(wěn)定性和一致性，

　　我們建議使用Streck等采血管替代普通的 EDTA抗凝管，

　　對于合作項目，艾斯基因提供專門的采血管!